病毒社区在五大湖的压载水
本文是两篇系列文章的第二部分。
编者按:本系列文章是通过学生参与项目的结果BOB体育密歇根州立大学的扩展和密歇根海格兰特帮助准备下一代的自然资源专业人士与扩展外联实践经验和参与。本文是两篇系列文章的第二个。
非入侵物种,如植物、鱼类、藻类、软体动物自1800年代以来一直影响五大湖。目前,有超过180个非本地物种建立在五大湖。(阅读第一篇文章。),以了解更多关于病毒的多样性社区,称为viromes,在压载水,研究人员转向了坦克在大湖港口的船只。bob体育登录
琼玫瑰主席,荷马Nowlin赋予水研究和密西根州立大学的同事们使用了宏基因组技术(bob体育登录例如,测序的社区DNA和RNA)调查病毒社区压载水在五BOB体育大湖地区和最近在《科学日报》发表了一篇文章“环境科学与技术”(Kim et al . 2015年)。作者分析了压载水样本来自不同来源(例如,船)在五大湖,配对样本Duluth-Superior港港水。通过分析,其中包括超过5.5亿个序列的生物信息学分析,作者发现大多数的病毒序列不匹配任何类群与参考序列相关(本质上不能确定通过图书馆的参考序列)。细菌病毒(噬菌体)中最丰富的样本压载和港口水域然而潜在新兴或重现病毒性病原体的鱼和虾也确定了。
特定的病毒病原体影响压载水样本中发现的鱼包括传染性脾肾坏死病毒,锦鲤疱疹病毒,和条纹杰克神经坏死病毒。第一次报告的疾病在欧洲,锦鲤疱疹病毒,或KHV,引入五大湖地区,多种常见鱼类死亡的原因,自2004年以来鲤鱼跃出物种。鱼锦鲤疱疹病毒病(KHVD)症状包括皮肤苍白的变色或变红,凹陷的眼睛,皮肤出血,鳍侵蚀,嗜睡;虽然有些鱼可能遭受损失的平衡,显示出极度活跃的迹象。尽可能多的鱼类疾病有相似的症状,病因由实验室测试验证。条纹杰克神经坏死病毒不同于KHV外部症状的病毒是罕见的,但被感染的鱼游泳表现出不稳定的模式,如旋转或破产的休息,他们的大脑,影响中枢神经系统和视网膜。条纹杰克神经坏死病毒被发现在世界的许多地方,包括国家在亚洲,欧洲,地中海,和北美——影响50多个易感的鱼类,包括条纹杰克,欧洲鲈鱼,石斑鱼,比目鱼。病毒性病原体影响虾中确定研究传染性肌坏死病毒,macrobrachium rosenbergii nodavirus, taura综合症病毒和白斑综合症病毒。白斑综合症在1992年首次出现在中国,在养殖虾造成了严重的影响。白斑综合症病毒导致白色斑点的外骨骼,也可以导致红色或粉红色的变色,这些症状,嗜睡和食品消费下降导致养殖虾的死亡率非常高。 It appeared in the Americas in 2001 through international trade of live shrimp and other crustaceans. These viral pathogens can cause a wide range of affects on fish and shrimp. By learning more about potential viral pathogens in ballast water, the study contributes to improving our knowledge of water treatment methods needed to inactivate the viral pathogens.
淡水viromes在本研究样本在湖泊帕文viromes发现密切相关,游荡在法国,并在一个南极湖泊,表明压载水被排放到五大湖包括分类来自世界各地的社区。事实上,船只在大湖港口来自世界各地,和放电约660万加仑的压载水每年进入五大湖。为了理解五大湖作为一个全球性的系统的一部分,我们必须能够看到整个画面和理解当地的关系问题必须遥远的地方。
使用这个概念称为telecoupling,开发的刘建国大学杰出的密歇根州立大学的渔业与野生动物教授和主任BOB体育中心系统集成和可持续性在密歇BOB体育根州立大学,我们可以更好地理解我们的全球互动,包括病毒性疾病的传播。Telecoupling检查在本地和全球自然和社会经济系统之间的关系,明确在这种情况下,经济和环境之间的联系部队在全球航运,商务部和这些病毒的介绍和传播在五大湖。(刘et al . 2013年)。
阅读更多
- 在本系列的第一部分:运输、商业和非本地物种的引入在五大湖
引用
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