bob体育登录MSU研究人员接受NSF赠款解决植物生物学大挑战

探索方法通过数学分析预测植物属性

阿拉伯二类Col-0和Ull2-3,并配有对比叶形状和开发可复制性左向相片rostets右向自上和侧视图X射线计算Tomscript扫描(Purple)和单叶隔离(Orange)照片由Dan Chitwood提供
阿拉伯二类Col-0和Ull2-3,并配有对比叶形状和开发可复制性左向相片rostets右向自上和侧视图X射线计算Tomscript扫描(Purple)和单叶隔离(Orange)照片由Dan Chitwood提供

东宁市,MichBOB体育密歇根州立大学分子植物科学家丹契特接受64万元赠款,这是国家科学基金会150万美元大协作奖的一部分,学习如何预测植物型-可见物理特征-从基因构造或分子剖析中预测植物型-可见物理特征

当前测序技术允许提取基因组中几乎所有信息,Chitwood表示测量生物或生物最终变异在基因组测序方面没有进展科学家尚无法测量嵌入生物物理形式的全部信息,像基因组一样

Dan.chitwood.jpg
Dan Chitwood,MSU园艺系助理教授

光从生物中提取所有信息 就能造模型预测生物华府市基因组信息-它仍然是生物大挑战

bob体育登录奇特伍德表示研究团队将使用数学方法,通常数学内部署的这种分析形式确认所有形状都是数据,所有数据都有形状

bob体育登录研究者将使用X-Ray计算托文学系统扫描植物叶子-非损耗方法提供内三维图像归微数或百万分之一表-并评价叶形和基因表达式等属性

数据字面化(标出出)形状,字面化结构-它(构件)叶子,MSU助理教授Chitwood说园艺局成员MSU计算数学科学工程系.

奇特伍德团队将测量叶子的方位特征 从不同的轴运行通过CT扫描

Chitwood表示分析将生成内容信息汇总嵌入所研究植物叶子-Arabidopsis和Capsella树类-植物生物中广泛用作模型生物的小开花植物

Elizabeth-munch-headshot.jpg
Elizabeth Munch,MSU计算数学科学工程系副教授

项目将在多所大学协同实施。bob体育登录MSU研究者中也包括伊丽莎白蒙奇CMSE副教授罗伯特范布伦园艺系助理教授艾米莉约瑟斯植物生物系助理教授也在项目上协作

bob体育登录MSU外的研究人员人丈夫宾夕法尼亚大学助理教授Arjun克利须那科罗拉多大学副教授阿里扬德拉鲁贡-卡多索Mexico国立自治大学教授

Chitwood与Rougon-Cardoso和VanBuren一起开发了一系列免费双语课程,教程包括编码、植物生物学、计算学和生物信息学植物和Python合并植物生物学家和数据科学家的工作美国学生并使用课程帮助团队分析叶子数据

奇特伍德说,“这个赠款不寻常 因为我们实际带真数学 和生物题并发。”新疆域变得不自在 我们从未探索

名副其实的学科间馈赠

分析并编码数据的目的是开发模型预测生物可基于完全基因集内小说模型使用预测叶形

奇特伍德表示:「它被称为大挑战”(包括科学界),

robert.vanburen.png
Robert VanBuren,MSU园艺系助理教授

奇特伍德表示新模型能帮助预测生物从基因表达模式中的整体性

当前,唯一方法育种者知道 植物将是什么或它将如何响应环境 基础是基因组合奇特伍德说像这个模型会加速育种速度 消除每次种植需求

奇特伍德表示:「如果你能预测生物体会得到什么基因表达剖面图,

集合从未编码的植物生物学家 数据科学家新从两个不同国家 种植科学bob体育登录Chitwood表示方法不仅消除应用科学与理论数学之间的差距,它动员世界各地的研究人员协同工作。

Chitwood说道,“我们正在创建跨学科对话:数学和生物学”。人说,'你正在控制数据革命'。'我们(植物生物学家)确实拥有数据科学家开发的工具-我们只需要应用这些工具

bob体育登录跨学科研究从文化间角度集合团体不仅从学科入手,而且从全球范围逐国入手或多或少交换资讯, 有些东西我们可以从不同群组学习(遍及世界)

赠款推广国家科学基金会任务促进科学进步 推进国家健康 繁荣福利 安全国防

bob体育登录除Chitwood640 000美元的赠款外,Husbands在宾夕法尼亚大学收到526 000美元的赠款,Krishnan在科罗拉多大学收到334 000美元的赠款以完成这项研究

Chitwood说,“这是真正的协作奖”。

发现这篇文章有用吗