分子标识器
序言:
实验开始开发分子标识 连接豆经济特征Phillip Miklas加入实验室后作为博士科学家时标选择RAPD标记, 并用RAPD标记绘制首个生锈抗药基因工作拓展到标记其他基因调节抗生锈、炭疽杆菌和豆类常见马赛克病毒所有这些病原体都受大基因控制,查找链接标记成为例例例方法不同于其他作物种类使用法,后者的目标是开发遗传联系图开发像NILs等基因群是为了让我们在没有饱和基因图的情况下对基因作专用标签分批分析等其他方法改进了这一努力。发现并发相位标识并记录标识辅助选择中这些类型效率差异技术推理后,RAPD标记转换为SCAR标记,其中许多cAR标记在其他实验室广泛使用分子标识的可用性易用鼓励豆育者使用这一技术,并允许在没有病原体时选择抗药性特征分子标记还用于扩充豆基因联系图并允许绘制许多抗生素并发现抗生素控制主要病原体论文编者在1995年、1998年、2003年、2004年和2006年发表并归纳出一系列评论文章SCAR标记连接各种抗药性基因
科学进取量化特征分析时,使用新标识系统提供更广泛的基因组覆盖其中包括AFLP、TRAP、分区域行动方案和微型卫星或SER标记使用这些标记系统检测出多枚QTL抗药性、收成和质量多QTL实际作用微小,在不同遗传背景和/或环境中怀疑使用QTL此外,高度关联豆培料之间缺乏适当多态标识极大地限制了MAS除主要基因特征外用于豆培多数映射研究都涉及基因池交叉体,这些交叉体太多样化,无法用于豆类育种整体QTL量化特性分析尚未广泛应用到豆类育种中,并反映在其他作物的相似经验中。
豆基因组学当前进展和豆序列信息提供上头BeanCAP项目正在开发SNP标识符,预计2011年可提供6KSNP芯片此外,NDSU同僚正在开发英德尔标记并有良好的基因组覆盖选择最小片长差为10bp的标记 在不同豆类中多态豆苗使用SCAR标记这些Indel标记“方便breeder”,因为它们可以在小实验室用arose gels运行,很容易分得而无需化学染色开发中用于常见豆的新标记系统在基因组中更为丰富,并比十年前使用的标记多态性更多此外,这些标记比较强健,因为它们可能更接近或内部基因,而不是离兴趣基因有距离地连接商业豆类中多态标记可提供,大多数播种和选择工作都在那里进行,这将提高MAS的使用速度,加速选择过程并提供基因金字塔化的机会大豆近邻会继续提供新契机查找常见豆不易检测到的感兴趣基因
选择引用 :
Kelly JD1995年随机放大多态脱氧核糖核酸标识HortScience 30:461-465
Kelly JD和PN米克拉斯1998年RAPD标志作用分子移植4:1-11
KellyJDPGepts P.NMiklas和DP科因州2003年标签和映射基因和QTL与分子标识辅助选择bob体育登录田田研究82:135-154
Kelly JD和VA.瓦列霍市2004年综合审查大基因调节对常用豆类炭疽杆菌的抗药性HortScience39:1196-1207
Miklas P.N.J.D.Kelly SE比比和MW.布莱尔2006年常见豆对非生物压力的抗药性:从经典到MAS育种Euphytica147:105-131
表1标志类型和缩写
RAPD-随机放大多态DNA
scal-序列特征放大区域
ALFP-放大分片长多态
TRAP-目标区域放大多态
分区域行动方案-序列放大多态
SER-简单序列重复,aka微型卫星
SNP-单核多态
inDel-插入删除
QTL-量化轨迹
NIL-近源线
MAS-标识辅助选择